2018.
Re-evaluación de la diversidad de especies del género de coral Pocillopora en arrecifes del Pacífico colombiano. Departamento Administrativo de Ciencia, Tecnología e Innovación (COLCIENCIAS). Col. 226’396.400 (US$ 71454). (F.A. Zapata, Investigador Principal).
2016
Evaluación de cuatro especies de coral para la restauración de arrecifes en el Pacifico Oriental Tropical. Fundación para la Promoción de la Investigación y la Tecnología del Banco de la República. Col. 18’000.000 (US$ 6000). (F.A. Zapata, M. López-Victoria y V. Pizarro, Co-investigadores Principales).
2014
Dispersión y conectividad de peces damisela entre Áreas Marinas Protegidas del Pacífico colombiano: implicaciones biogeográficas. Departamento Administrativo de Ciencia, Tecnología e Innovación (COLCIENCIAS). Col. 152’174.000 (US$63405). (F.A. Zapata, Investigador Principal).
Relación entre las tasas de bioerosión y bioacreción de arrecifes coralinos de la Isla Gorgona, Pacífico Colombiano. Departamento Administrativo de Ciencia, Tecnología e Innovación (COLCIENCIAS). Col. 249’888.137 (US$ 100145). (Edgardo Londoño, Investigador Principal).
2013
Evaluación del impacto de las mareas bajas extremas y la sedimentación sobre el crecimiento y la reproducción del coral Pocillopora damicornis en la isla Gorgona. Universidad del Valle. Col. $30.000.000 (US $15540). (F.A. Zapata, Investigador Principal).
Monitoreo de condiciones ambientales y características biológicas de los arrecifes coralinos, y ambiente pelágico durante 2012 en localidades pertenecientes al sistema nacional de parques nacionales priorizadas por la Territorial Pacífico y fortalecimiento de capacidades técnicas y científicas de funcionarios y comunidades locales. Patrimonio Natural Fondo para la Biodiversidad y Areas Protegidas. Col. $174.068.000 (US $90167). (A. Giraldo, Investigador Principal).
2009
Evaluación del estado actual de los objetos de conservación faunísticos en Isla Gorgona: una aproximación holística a la valoración ecológica del PNN Gorgona. Alianza Fondo Para La Acción Ambiental y la Niñez – Conservación Internacional. (Co-Investigador; A. Giraldo, Investigador Principal).
Dinámica temporal y patrones de variación espacial del reclutamiento coralino en dos arrecifes de Isla Gorgona, Pacífico Oriental Tropical. Investigador Principal. Departamento Administrativo de Ciencia, Tecnología e Innovación (COLCIENCIAS). Col. $217.155.000 (US $111.000) – Universidad del Valle Col $15.000.000 (US $7.684). (F.A. Zapata, Investigador Principal).
Comparación de métodos usados para la evaluación del estado de los arrecifes coralinos del Corredor Marino del Pacífico Este Tropical y análisis preliminar de la elasticidad de los arrecifes coralinos del Parque Nacional Natural Isla Gorgona (Colombia). Conservation International Foundation Col. $75.644.000 (US $32182) – Universidad del Valle Col. $7.570.000 (US $3220). (F.A. Zapata, Investigador Principal).
2007
Caracterización ecológica de los arrecifes coralinos y bosques de manglar en Cabo Marzo, zona norte del litoral Pacífico colombiano: estructura, composición, diversidad y fauna asociada. Conservation International Foundation $58.000.000, Universidad del Valle 42.617.000 (Alan Giraldo, Investigador Principal).
2006
Aspectos ecológicos de la comunidad de peces crípticos epibentónicos en el arrecife coralino de La Azufrada, Isla Gorgona. (A. Giraldo, Investigador Principal). Fundación para la Promoción de la Investigación y la Tecnología, Banco de la República, Bogotá. Col. $13.440.000 (US $5264).
2004
Factores físicos, entorno oceanográfico y distribución de arrecifes coralinos en el Parque Nacional Natural Isla Gorgona (F.A. Zapata y A. Giraldo, Co-Investigadores Principales). Instituto Colombiano para el Desarrollo de la Ciencia y la Tecnología (COLCIENCIAS). Col. $99.8 Millones (US $42500).